乔峰抵达无锡，在城外松鹤楼饮酒，偶遇段誉，二人互相欣赏，结为金兰。途径杏子林时，帮众告诉乔峰，有人闯入大义分舵，身手了得，乔峰赶往，发现闯入者是燕子坞四人（包不同、阿朱、王语嫣、阿碧），随后燕子坞的风波恶和丐帮宋奚陈吴四长老到场，双方互殴。
在双方恶斗之时，杏子林四周出现许多丐帮帮众，但帮中的首脑人物，很多不在场。乔峰担心帮内出现变故，又不愿在查明真相前与燕子坞结仇，出绝技制服风波恶。燕子坞众人折服，意欲离去，乔峰同意。丐帮长老全冠清对乔峰的做法提出质疑，丝毫没有下属之礼。乔峰见他辞意不善，又察觉到诸帮众的神气大异平常，断定丐帮出现了重大变故。[2]
乔峰询问内情，发觉全冠清和四长老均参与此次事变，大仁、大信、大勇、大礼四舵的舵主和传功、执法两位长老处境危险，决定擒贼先擒王，施展平生绝学，眨眼间制服全冠清。乔峰成功平定叛乱后，命张全祥引导大义分舵蒋舵主，去请传功、执法长老诸人。
众人到齐后，诉说原委，原来众长老均被全冠清囚禁在太湖的船上。乔峰追问原因，吴长风道出内情：要废去乔峰的帮主之位。参与叛乱的四长老认错，乔峰依照帮规“自流鲜血、洗人之罪”，赦免了四长老的罪责。全冠清却不服，认为大宋的锦绣江山，将沦亡于夷狄。
说话间，大信舵派往西夏刺探消息的弟子传来消息，西夏紧急军情，蜡丸传书。乔峰捏碎蜡丸，正要打开，丐帮元老徐冲霄恰到，不准拆看。并告知马大元的遗孀马夫人（即康敏）即将到来，要众人等候。
在等待过程中，又有多人到场：太行山冲霄洞的谭公、谭婆，谭婆的师兄赵钱孙，泰山五雄，智光和尚。随后马夫人到场。原来，马夫人检点遗物，发现马大元的遗书和一封信，遗书注明若马大元死于非命，此信立即交丐帮诸长老会同拆阅。故而马夫人将信交于徐长老，徐长老拆信发现信内字迹笔致遒劲，收信人是“剑髯吾兄”—前任丐帮帮主汪剑通的别号，信尾署名令人惊异。
在众人注目下，多名了解内情的人共同揭开了一个秘密：三十年前，在雁门关外，乱石谷前的一场血战。
三十年前，中原豪杰接到讯息，契丹国有大批武士要来偷袭少林寺，想将寺中秘藏数百年的武功图谱，一举夺去。中原武林人士担心契丹人夺取秘笈，军中人人习练，战场之上，大宋官兵将不是敌手，于是派人通知少林寺严加戒备，同时遴选精锐兼程赶去雁门关外迎击。
抵达雁门关后，中原武林的21名高手，在带头大哥带领下，埋伏待敌。契丹武士到来后，埋伏的诸人暗器齐发，一举歼灭了全部敌人，随后契丹人又有一男一女怀抱婴儿骑马而来。众人围攻而上，斩杀了女人，不料契丹武士武功深不可测，击毙了大部分中原高手，随后在石壁上刻上遗书，跳崖自尽。
雁门惨案后，少林寺严阵待敌，三个月后却毫无动静，众人方知被人所骗
带头大哥、汪剑通和智光和尚侥幸逃脱，便用白布拓下遗书，将契丹婴儿交给乔三槐夫妇抚养，取名乔峰。七岁时，玄苦大师传授武艺，16岁时，汪剑通收为嫡传弟子，泰山大会后，传授打狗棒法，立为丐帮帮主。乔峰实为生于辽国长于大宋的契丹人。
乔峰继任帮主后，汪剑通立书，若乔峰亲辽叛汉，帮众直接击杀，不得有误
乔峰身世已明，无法继续待在丐帮，便交出打狗棒，扬长而去。
乔峰离开后，以四大恶人为首的西夏一品堂杀到杏林，撒布毒药“悲su清风”，qun丐纷纷倒地。段誉救出王语嫣，随后化妆为乔峰和慕容复，搭救出被关押在天宁寺的丐帮诸人。
乔峰随后赶上，救下阿朱和阿碧，得知丐帮众兄弟为西夏人所擒，赶往天宁寺，被众人大加感谢。[
追查真相
离开天龙寺，乔峰思绪万千，担心这一切是大奸大恶之人的诬陷，决定先向养父母和师父询问真相。
乔峰首先赶回少室山，发现乔三槐夫妇已被极厉害的掌力击毙在卧房，xiong口肋骨根根断绝。乔峰随后飞奔至少林寺，见着师父，没想到玄苦见到乔峰，突然间脸色大变，连说三个“好”字，圆寂了。乔峰决定查明真相，于是高声呼叫方丈，得知玄苦曾受人偷袭，xiong间中了一掌重手。而此时送药的小沙弥认定乔峰就是杀人凶手。
乔峰不愿与少林僧人交手，躲到菩提院后殿佛像后，却遇到乔装成僧人前来盗书的阿朱。藏匿之所被随后追到的方丈诸人发现，乔峰以亢龙有悔抵住玄寂的掌法“一拍两散”，但阿朱却被大力金刚掌扫到，身负重伤
乔峰决定要救活阿朱，赶往少室山下的许家集，救治无果。乔峰担心阿朱死去，陪在她身边讲自己七岁时因大夫欺负母亲而第一次杀人的故事。阿朱感叹说这个孩子真像契丹人，那么凶狠。乔峰很受伤，觉得自己竟无容身之所。
乔峰听到神医薛慕华和游氏双雄在聚贤庄举办英雄大会，
为了给阿朱治病，乔峰决定冒险参加。薛神医诊断清楚，但不愿救治。qun雄齐声呐喊，纷纷拿出兵刃。乔峰虽曾立誓不杀汉人，但不得不大开杀戒，面对三百馀人，只得拼命相抟，自己亦为护阿朱已致身受重伤，幸被黑衣人“恩公”救回
乔峰伤愈后去雁门关查看石壁上生父留下的字迹，发现有人故意将留下的字迹削去。乔峰呆立在石壁之前，回想前情，暴躁之下大喊：我不是汉人！我是契丹胡虏！而此时，却出现了已经在此等待了五天的阿朱。原来白世镜答允传薛慕华七招“缠丝擒拿手”换来他为阿朱治伤。伤好后，阿朱乔装打扮成薛慕华走脱聚贤庄。此时乔峰才知道天宁寺救人的“乔峰”就是阿朱。
在雁门关，乔峰目睹了宋兵的暴行，领悟到了民族战争的残酷，决定不再以契丹人为耻，也不以大宋为荣。乔峰决定先为父报仇，找到带头大哥。阿朱愿意一辈子相从。乔峰被阿朱情意深深感动，与阿朱携手下山，相互爱恋。
出了雁门关，乔峰和阿朱乔装进入卫辉，丐帮正在祭奠徐长老。乔峰抓住赵钱孙和谭婆，追问带头大哥，被拒绝。乔峰点中二人穴道，安置在船上，找到谭公，打算以谭婆相威胁逼问真相。但回到船上后，发现赵钱孙和谭婆已经被人用杀害，用的正是自己的掌法。
乔峰预感到大恶人武功超强，且行事总是快自己一步。决定赶紧赶在大恶人之前询问剩下为数不多知道真相的人。乔峰来到泰安，不料未到庄前，单家已被一把火烧成了白地。乔峰赶到天台山的止观寺，见到智光，智光告诉乔峰，他的生父叫萧远山，自己本名是萧峰。萧峰追问带头大哥，智光留下禅语服毒自尽。
萧峰决定前往信阳，寻找马夫人。二人乔装后进入马夫人住处，阿朱装成白世镜套出带头大哥就是大理镇南王段正淳。大理段式的一阳指和六脉神剑名震天下，阿朱告知萧峰慕容复的父亲认为天下武功在于精，并以未得到易筋经和六脉神剑为憾，如果能得到易筋经或许能战胜段式绝学，并吐露出自己在少林寺偷走的经书正是易筋经，可惜二人打开后发现是梵文书写，无法阅读。
萧峰寻至小镜湖方竹林，段正淳正在与隐居于此的旧情人阮星竹重温鸳梦。段延庆追杀段正淳，乔峰担心仇敌死于他手，出手相救。得知段正淳的FengLiu往事。[9]
萧峰问段正淳当年是否做过一件于心有愧的大错事，害得一个孩子一生孤苦，段正淳低头认罪。萧峰确认仇人，约定三更在青石桥上相见。三更时分，大雨滂沱，萧峰全力一击，段正淳并未闪避，一掌之下即奄奄一息。萧峰感觉到对手身子较白天变轻，近视才发现是阿朱，萧峰大惊。阿朱告诉乔峰，自己和阿紫左肩均有一个“段”字，是亲生姊妹，父亲正是段正淳，母亲则是阮星竹。阿朱乔装就是为了能消去萧峰的仇恨，担心乔峰冤冤相报，不敌大理段式的六脉神剑。临死前阿朱遗愿托付萧峰照顾阿紫。
萧峰走到后院，打死殉情同穴而葬，写墓碑时发现段正淳的笔迹，与杏林所见不同。萧峰知道事有蹊跷，决定跟踪阿紫众人，当面质问段正淳。一路追随阿紫留下来的记号，萧峰意外发现，段正淳竟然在马夫人家
萧峰跟随阿紫众人来到马家窗外，发现段正淳已经中了马夫人的“十香迷魂散”，决定静观其变。随后发现马夫人是段正淳的旧情人，而帮内叛徒竟是马夫人的姘夫白世镜，马夫人和白世镜打算杀了段正淳，却反被一蒙面人杀了白世镜。萧峰追赶蒙面人，被对方要求不要追赶。萧峰想到自己的契丹人身世，折身而回。
到了马家，马夫人已被阿紫制服，萧峰追问内情，马夫人揭示真相：只因为她自恃MeiYan，足以颠倒天下男子，偏偏萧峰不为MeiSe所动，因情生怨，便勾结马大元欲揭穿萧峰身世，行动失败后便联合白世镜杀害马大元，嫁祸慕容复。而阿朱当时的乔装，早已被马夫人识破，她正要杀段正淳，正好将计就计假手于萧峰。萧峰正欲追问带头大哥的身份，马夫人已死。
萧峰意识到中原已非自己所居之地，杀父杀母的大仇也无法得报，打算前去塞北，从此不再回来。阿紫以回星宿海为由，选择跟随。
阿紫跟随萧峰来到塞北，遭到星宿海的几位师兄前来追讨阿紫盗走的神木鼎，萧峰出手帮忙，击退星宿派诸人。但也反感星宿派的阿谀风气和残酷手段。萧峰继续向雁门关前行，阿紫装作死亡，偷袭萧峰，萧峰为躲避毒针，重伤阿紫。想到阿朱，萧峰非常后悔，便以真气为阿紫续命。萧峰发现人参可以续命，抱着阿紫前往长白山寻找人参，坚持为给阿紫治伤。
在长白山，乔峰意外结识了女真族的完颜阿骨打，随后在跟随女真出猎时又偶遇契丹人，乔峰击退契丹人并俘虏了耶律基。萧峰感叹耶律基是条好汉，私下释放，并与之结为义兄弟。[13]
阿紫在人参的疗养下，伤情渐渐好转，遂要求萧峰西行数日，遇见正在操练的契丹士兵，得知义兄耶律基就是大辽皇帝耶律洪基。萧峰进入辽国，协助耶律洪基平定了上京叛乱，官拜南院大王，受封楚王，职责是坐镇南京，俟机进讨中原。
萧峰在任内，目睹辽兵俘虏宋人，心有感触，加以释放，却发现其中有当日聚贤庄大战后遗留的孤儿游坦之，萧峰睹物思人，迷乱中丢失了易筋经，被游坦之获得。游坦之被辽兵抓回，对阿紫一见倾心，但阿紫却不喜欢他，将他做成了铁头人。
决战少林
阿紫外出，陷身丐帮。萧峰非常担心，率领“燕云十八骑”赶赴少林。
来到河南，萧峰得知阿紫双目已盲，铁头人游坦之担任丐帮帮主。萧峰进入少林，发现丁春秋手中抓着阿紫，乔峰两招亢龙有悔，救出阿紫，并从玄慈方丈口中得知他就是“带头大哥”。qun雄见萧峰出现，打算联力诛杀。慕容复为了得到武林盟主之位，打算挑战萧峰，争取天下武林人士之心
段誉认出萧峰，引见义兄虚竹，三人当庭再结金兰。兄弟三人联手，分别对战慕容复、游坦之和丁春秋。数招之后，萧峰踢断游坦之shuang腿，虚竹给丁春秋种下生死符，段誉以六脉神剑战败慕容复。慕容复心灰意冷，打算自尽，突然出现一名灰衣僧救下。灰衣僧意图决战萧峰，被到场的一名黑衣人拦下。灰衣僧自报名为慕容博，慕容复之父；萧峰也得知黑衣人正是生父萧远山。原来二人在少林寺数十年，偷学少林武功，而杀害乔氏夫妇、玄苦等人的正是自己苦苦追寻的“大恶人”和“恩公”正是自己的父亲萧远山。雁门关之战时假传消息的正是慕容博。[16]
萧峰父子联力战慕容父子，慕容博进入藏经阁。藏经阁内，鸠摩智与慕容博故知，形成三打二。慕容博报出自己乃是燕国之后，为求复国，愿意一死，要求萧峰率领大辽、鸠摩智兵发吐蕃，与慕容复一道瓜分大宋，以光复大燕国，被萧峰拒绝。五人正欲激战，被扫地僧阻止。扫地僧说出武功与佛法的相辅相成之理，指出萧远山等三人皆因修炼武功已经病入膏肓。扫地僧以“龟息”之术医治萧远山和慕容博，二人抛下恩怨，皈依佛门。
虚竹认为天山派可以治好阿紫的眼睛，萧峰答应陪着前去灵鹫宫。
出了少林后，众人发现许多武林人士前去西夏，原来西夏在招驸马，众人决定前去西夏，虚竹刚好去找梦姑，而段誉则得到父亲命令，务必当选驸马，促成大理和西夏的联姻。
三人结伴来到西夏，西夏公主对所有应征之人提出三个问题，萧峰见并无危险，且所问之题勾起自己对阿朱的思想之情，心绪悲凉，转身离去，回到大辽。[
1093年，高太后病逝，宋哲宗掌权，降苏辙为端明殿学士。耶律洪基得悉消息，
摆驾南京，晋封萧峰为宋王，以平南大元帅统率三军，准备南征大宋，御驾汴梁。萧峰不愿见到生灵涂炭，拒绝南征，请求辞官隐居，耶律洪基非常不高兴，但还是赏赐了萧峰，并封阿紫为平南公主。
此时，游坦之牺牲双目已换来阿紫的重见光明。阿紫向萧峰吐露心声，在萧峰误伤阿紫后的日夜治疗中，已经倾慕萧峰，但萧峰心中只有阿朱一人，并发誓终生不婚。
耶律洪基几次降旨催促萧峰发兵，萧峰封金挂印，打算辞官。辽王担心萧峰谋反，采用穆贵妃计策，以圣水欺骗阿紫，阿紫为获得萧峰之爱，给萧峰暗下圣水。萧峰因为中毒，被兵士抓获，途中阿紫跳水得脱。
阿紫逃脱后，遇到丐帮长老吴长风，诉说原委，吴长风当即传出丐帮“青竹令”，将萧峰的大仁大义遍告中原各路英雄。中原武林为萧峰的仁义所感，由少林众高僧带头，中原qun豪、大理、灵柩宫等一应众人联手前往南京解决萧峰。qun雄救出萧峰，萧峰也得见义弟，大理皇帝段誉和西夏驸马虚竹。
qun雄夜战南京城，尸骸重叠，双方均伤亡惨重。正在危机之际，完颜阿骨打领兵前来接应，救出众人，旋即离去。一行人续向西行，辽军一路烧杀，紧追不放。qun雄直奔雁门关，打算进关后扼险而守。
众人抵达雁门关，辽军已经逼近。守关将士却担心奸细混入，并不开关放入。
萧峰决定找辽帝对话，耶律洪基出阵。虚竹和段誉借机擒住辽帝，萧峰提议放回，条件是要耶律洪基许诺立即退兵，并答应终其一生不许辽军一兵一卒越过宋辽疆界，否则同归于尽，玉石俱焚。耶律洪基权衡轻重，折箭为誓，选择退兵。
退敌辽兵后，萧峰念及自己身为契丹人，威迫辽帝，成为契丹的大罪人，再无面目立于天地之间，选择自戕而亡。
阿紫痛苦欲绝，挖出双目送回游坦之，抱着萧峰的尸体跌入雁门关的万丈深谷，这里正是三十多年前萧峰生母的葬尸之所
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